Marco Ferrari a soutenu sa thèse en histoire ancienne dans le cadre d’une cotutelle internationale de thèse entre l’Université de Rome « Sapienza » et l’École Pratique des Hautes Études-PSL (CeRMI) de Paris (2021–2025). Ses intérêts de recherche portent sur les relations entre le monde égéen – en particulier les Grecs d’Asie Mineure – et l’empire perse achéménide (VI^e–IV^e s. av. J.-C.).

Il mène actuellement, auprès de l’IFEA et de l’ANAMED, un projet intitulé (en anglais) : « Integration and assimilation of the irano-anatolian elites in the Achaemenid satrapy of Skudra ». Cette recherche analyse les dynamiques politiques et culturelles qui ont accompagné l’établissement du pouvoir achéménide dans le nord-ouest de l’Anatolie, ainsi que le processus d’intégration des élites iraniennes et locales au sein de la satrapie de Skudra.