Pôles
La recherche à l'IFEA se structure autour de pôles interdisciplinaires dans lesquels s'inscrivent les différents programmes menés par les chercheurs.
- Le pôle Archéologie, dont la coordination scientifique est assurée par Néhémie Strupler
- Le pôle d'Études contemporaines dont la coordination scientifique est assurée par Sümbül Kaya
Observatoires
Deux observatoires, dédiés aux problématiques contemporaines et agissant comme des lieux d'accueil et de ressources, sont rattachés au pôle correspondant : l'Observatoire Urbain d'Istanbul et l'Observatoire de la Vie Politique Turque.
L'observatoire du Caucase à Bakou était une antenne créée en 2003 dont les activités ont pris fin en août 2016.
Axes transversaux
Les axes de recherche transdisciplinaires à l'IFEA s'appuient sur le plus petit mais puissant dénominateur commun qu'est le territoire turc dans toute son ampleur, ainsi que ses langues. Ces axes transversaux – qui fondent en partie l’identité et la spécificité de l’équipe sont matérialisés par les travaux et rencontres scientifiques inscrites au programme de l'institut.