L'Institut publie deux revues internationales de spécialisation, l'une dans le domaine de l'archéologie anatolienne (Anatolia Antiqua), l'autre dans le domaine des études turques et ottomanes (Anatolia Moderna).

L'IFEA a inauguré en 2010 deux collections de publications en partenariat avec les éditions İsis et Kitapyayınevi. Les derniers ouvrages parus figurent ci-dessous :

• A. Pralong (éd.), Bizans. Yapılar, Meydanlar,Yaşamlar, IFEA/Kitapyayınevi, nov. 2011
• N. Şeni, Naissance du "devoir d'ingérence" : les carnets du voyage d'Adolphe Crémieux en Égypte 1840, IFEA/Isis, nov. 2011

Par le passé, l'IFEA a également publié des ouvrages dans les collections suivantes :
Passé ottoman, présent turc (avec Maisonneuve et Larose)
Rencontres d'Istanbul
Bibliothèque turque (avec Actes Sud)